Análises moleculares para bioinsumos: identidade, qualidade e regulação
O Brasil é um dos maiores mercados de bioinsumos do mundo, e a régua de…
O Brasil é um dos maiores mercados de bioinsumos do mundo, e a régua de qualidade do setor subiu. Comprovar, por biologia molecular, que um produto contém exatamente o microrganismo certo, na concentração certa e sem contaminantes, deixou de ser diferencial e passou a ser requisito. Por que bioinsumos exigem análise molecular A eficácia de…
qPCR (PCR quantitativa, ou PCR em tempo real) é uma técnica que amplifica uma região específica do DNA e, ao mesmo tempo, mede a quantidade gerada a cada ciclo. É uma das ferramentas mais versáteis e confiáveis da biologia molecular. Como funciona o qPCR Assim como na PCR convencional, a reação copia exponencialmente o alvo. A…
Controle de qualidade molecular é o uso de técnicas de biologia molecular — principalmente o qPCR — para detectar, identificar e quantificar microrganismos em processos e produtos industriais. Ele resolve duas limitações históricas da microbiologia clássica: a lentidão e a dependência do cultivo. O problema com a microbiologia tradicional Métodos baseados em cultura podem levar…
Identificação molecular de espécies é a determinação da identidade de um organismo a partir da sua sequência de DNA, e não da sua aparência. É a forma mais confiável de responder à pergunta: afinal, qual é exatamente esta espécie? Por que a morfologia não basta Muitos microrganismos são indistinguíveis ao microscópio, e diferentes espécies podem…
O transcriptoma é o conjunto de RNAs produzidos por uma célula ou organismo em uma determinada condição. Enquanto o genoma mostra o que um organismo pode fazer, o transcriptoma mostra o que ele está de fato fazendo naquele momento. A técnica que o mede é o RNA-Seq (sequenciamento de RNA). Por que medir expressão gênica Ter…
Metagenômica shotgun é a abordagem que sequencia todo o DNA presente em uma amostra ambiental, sem se limitar a um gene marcador. É o que a diferencia do sequenciamento por amplicon (16S para bactérias, ITS para fungos), que lê apenas uma região específica. Amplicon: a lista de moradores O amplicon amplifica um gene marcador e o sequencia para listar quais grupos estão presentes e…
A análise de microbioma por NGS identifica e quantifica os microrganismos presentes em uma amostra — solo, água, produto, alimento ou hospedeiro. Em vez de cultivar (o que deixa de fora a maioria dos microrganismos), ela lê diretamente o DNA da comunidade. Como funciona: sequenciamento por amplicon (16S e ITS) A abordagem mais usada amplifica…
O sequenciamento de genoma completo (WGS, do inglês whole genome sequencing) é a leitura de todo o material genético de um organismo — não apenas de um gene ou região. O resultado é o manual de instruções completo daquele organismo: tudo o que ele é capaz de fazer está codificado ali. O que o genoma completo revela Como funciona o fluxo de…
Interpretação de dados genéticos é o processo de transformar as leituras brutas de um sequenciamento em conhecimento aplicável a uma pergunta concreta. Com o barateamento do sequenciamento, gerar dados deixou de ser o desafio. O novo gargalo é dar sentido a eles. Por que o dado bruto, sozinho, vale pouco Um sequenciamento gera milhões de…
Sanger e NGS são duas tecnologias de sequenciamento de DNA com propósitos diferentes. O sequenciamento Sanger lê um fragmento de DNA por vez, com acurácia excepcional. O sequenciamento de nova geração (NGS) lê milhões a bilhões de fragmentos simultaneamente, permitindo enxergar genomas e comunidades inteiras. A pergunta certa não é ‘qual é melhor’, e sim…