Transcriptoma e RNA-Seq: como medir a expressão gênica

O transcriptoma é o conjunto de RNAs produzidos por uma célula ou organismo em uma determinada condição. Enquanto o genoma mostra o que um organismo pode fazer, o transcriptoma mostra o que ele está de fato fazendo naquele momento. A técnica que o mede é o RNA-Seq (sequenciamento de RNA).

Por que medir expressão gênica

Ter um gene não significa usá-lo. Genes são ligados e desligados o tempo todo em resposta a estímulos — temperatura, nutrientes, presença de um produto, estresse. Medir quais genes estão ativos revela os mecanismos por trás de um efeito observado.

Como funciona o RNA-Seq

1. Extração do RNA da amostra, com cuidado redobrado por ser uma molécula instável.

2. Construção da biblioteca de sequenciamento a partir do RNA.

3. Sequenciamento em NGS, tipicamente com leituras paired-end e milhões de leituras por amostra.

4. Análise de expressão: quantificação dos transcritos e comparação entre condições.

Análise de expressão diferencial

Comparando duas ou mais condições (por exemplo, com e sem tratamento), identificam-se os genes que aumentam ou diminuem a atividade. Essa análise de expressão diferencial é o coração de muitos estudos de mecanismo de ação.

Aplicações do transcriptoma

Entender o mecanismo de ação de um produto ou estímulo.

Estudar a resposta de um organismo a estresse ou a condições adversas.

Investigar regulação gênica e vias metabólicas ativas.

Apoiar o desenvolvimento de bioprodutos com base em evidência funcional.

No protocolo de transcriptoma da GoGenetic, cobrimos desde a extração de RNA até o sequenciamento com cerca de 10 milhões de leituras, sempre acompanhado da interpretação que conecta a expressão ao seu objetivo de pesquisa.

Perguntas frequentes (FAQ)

O que é transcriptoma?

É o conjunto de RNAs ativos em uma célula ou organismo em uma dada condição, ou seja, o retrato dos genes que estão sendo efetivamente usados naquele momento.

Qual a diferença entre genoma e transcriptoma?

O genoma mostra todos os genes que um organismo possui (o que ele pode fazer); o transcriptoma mostra quais genes estão ativos (o que ele está fazendo).

O que é RNA-Seq?

É a técnica de sequenciamento do RNA de uma amostra para medir a expressão gênica, identificando e quantificando os transcritos presentes.

Para que serve a análise de expressão diferencial?

Serve para comparar condições e descobrir quais genes têm a atividade aumentada ou reduzida, revelando mecanismos de ação e respostas biológicas.

Chamada para ação (CTA): Fale com o time técnico da GoGenetic pelo WhatsApp (41) 99215-1776 e descubra a análise ideal para o seu projeto.