A análise de microbioma por NGS identifica e quantifica os microrganismos presentes em uma amostra — solo, água, produto, alimento ou hospedeiro. Em vez de cultivar (o que deixa de fora a maioria dos microrganismos), ela lê diretamente o DNA da comunidade.
Como funciona: sequenciamento por amplicon (16S e ITS)
A abordagem mais usada amplifica e sequencia genes marcadores que funcionam como uma ‘impressão digital’ de cada grupo: o gene 16S rRNA para bactérias e arqueias, e a região ITS para fungos. Comparando essas sequências com bancos de referência, identificam-se os organismos presentes.
É possível trabalhar com um ou dois alvos, conforme o objetivo, e receber um laudo completo com análise de diversidade ou os dados brutos para análise própria.
O que são as métricas de diversidade
- Diversidade alfa: riqueza e equilíbrio dentro de uma mesma amostra.
- Diversidade beta: o quanto duas ou mais amostras diferem entre si.
- Abundância relativa: a proporção de cada grupo na comunidade.
Essas métricas transformam uma lista de organismos em informação interpretável sobre o estado do ambiente estudado.
Aplicações da análise de microbioma
- Saúde do solo e resposta a manejos e bioinsumos.
- Qualidade de água e de processos industriais.
- Caracterização de produtos e alimentos fermentados.
- Estudos de microbioma associado a plantas, animais e ao ser humano.
Amplicon ou shotgun?
O sequenciamento por amplicon responde ‘quem está presente’. Quando a pergunta envolve também ‘o que a comunidade é capaz de fazer’, o caminho é o metagenoma shotgun — assunto do nosso artigo dedicado.
Em todos os casos, o diferencial está em interpretar a diversidade: a GoGenetic entrega o significado por trás dos números, não apenas a tabela de organismos.
Perguntas frequentes (FAQ)
O que é análise de microbioma?
É a identificação dos microrganismos presentes em uma amostra a partir do sequenciamento do seu DNA, revelando a composição e a diversidade da comunidade microbiana.
O que são 16S e ITS?
São genes marcadores usados na identificação: o 16S rRNA caracteriza bactérias e arqueias, e a região ITS caracteriza fungos. Funcionam como impressões digitais de cada grupo.
Qual a diferença entre microbioma por amplicon e metagenoma shotgun?
O amplicon lê um gene marcador para listar os organismos; o shotgun sequencia todo o DNA da amostra, revelando também as funções e o potencial genético da comunidade.
Posso analisar o microbioma de qualquer amostra?
Sim. Solo, água, produtos, alimentos e amostras associadas a hospedeiros podem ser analisados, desde que a coleta preserve o material genético. A equipe orienta o protocolo correto.
Chamada para ação (CTA): Fale com o time técnico da GoGenetic pelo WhatsApp (41) 99215-1776 e descubra a análise ideal para o seu projeto.
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